Deseo saber si hay una manera de recuperar todos los articulos que ya estan creados y pasarlos al sitio nuevo sin necesidad de volver a hacerlos.

Si, por supuesto. Leete esto.

Tengo un sitio que ya esta hecho con spip, el cual ya contiene varios articulos. Debo de cambiar los esqueletos de estas paginas, por otros que nos han asignado.

Sin embargo para hacer lo que planteas, no es necesario que mudes tu sitio web: alcanza con que cambies tu esqueletos y todo andara igual. Respecto a donde poner los esqueletos, lee esto.